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Foire aux questions : Microbiote

Microbiote immunomodulateur

La muqueuse du tractus gastro-intestinal abrite le plus grand arsenal de lymphocytes de l'organisme. Aucun autre organe n'est capable de produire une si grande quantité d'anticorps. Les souches apathogènes d'E. coli et d'Enterococcus agissent comme des "compagnons" nécessaires de ces lymphocytes, pour l'entraînement correct du système immunitaire.

Le microbiote immunomodulateur régule et module le bon fonctionnement de tous les composants de l'immunité cellulaire et humorale au niveau local (plaques de Peyer, lymphocytes intraépithéliaux...), induisant des réponses immunitaires non spécifiques, maintenant ainsi un entraînement continu du système immunitaire.

Ces bactéries déterminent que la plupart des substances potentiellement antigéniques, ingérées par voie orale, ne déclenchent pas de réaction immunitaire spécifique (phénomènes de tolérance antigénique).

Dans l'ensemble, le taux de colonisation est bien inférieur à celui représenté par le microbiote protecteur, mais ils jouent un rôle fondamental.

 

Bactéries testées

  • Escherichia coli : Bien qu'elle soit généralement considérée comme une bactérie exclusivement pathogène, elle est un membre normal du microbiote intestinal et a un rôle immunomodulateur important, contribuant également à la résistance à la colonisation par des agents pathogènes.
  • Enterococcus sp. : Également bactérie aérobie normalement présente dans l'intestin grêle, avec un rôle prépondérant dans la production d'anticorps locaux (IgAs), dans l'acidification du milieu, et dans la résistance à la colonisation par des agents pathogènes.

 

Un résultat analytique inférieur à la plage normale augmente la susceptibilité du patient à souffrir de troubles immunitaires tels que des allergies, des maladies auto-immunes ou des déficits immunitaires.

 

Microbiote protecteur

Ce groupe de bactéries est indispensable au bon fonctionnement de l'ensemble du microbiote intestinal car elles protègent et empêchent la colonnisation et la croissance dans l'intestin de germes pathogènes.

Le microbiote protecteur, en plus des fonctions de barrière physique et immunologique, maintient le pH physiologiquement acide dans la lumière intestinale et l'intégrité de la barrière sélective qu'est la paroi intestinale (perméabilité intestinale).

Bactéries testées :

  • Lactobacilles sp. et Lactobacillus formant H2O2 : bactéries anaérobies facultatives et acidifiantes qui colonisent principalement l'intestin grêle. Ils ont un rôle de premier plan dans le maintien du pH et contre la croissance des agents pathogènes.
  • Bifidobacterium sp. : Bactéries anaérobies et acidifiantes qui colonisent principalement le gros intestin. Leur rôle dans la production de nutriments essentiels pour la muqueuse du côlon se démarque, et qu'ils agissent également sur les processus inflammatoires locaux, et que leur nombre élevé et leur large distribution sont considérés comme essentiels dans la résistance contre la colonisation des agents pathogènes.
  • Bacteroides sp. : Bactéries anaérobies et acidifiantes, réparties dans tout l'intestin (petit et gros). Son rôle dans le métabolisme des glucides complexes (facilitant leur utilisation par d'autres bactéries) et des sels biliaires se distingue, dans la production de substances source d'énergie et favorisant le transit intestinal, et dans la synthèse de substances antiobactériennes et antifongiques.

 

Ils peuvent endommager le microbiote protecteur :

  • La prise de médicaments (principalement des antibiotiques et des anti-inflammatoires)
  • Régimes alimentaires mal équilibrés (surcharge d'aliments raffinés et de produits laitiers animaux, etc.)
  • Apport de toxines (alcool, tabac...)
  • Stress
  • Infections intestinales (champignons ou parasites)

 

Un résultat analytique inférieur à la plage normale entraîne :

Une diminution des systèmes protecteurs de la barrière intestinale, laissant des niches écologiques libres pouvant être occupées par des agents pathogènes.
Cette situation peut favoriser l'apparition d'une dysbiose qui altère l'équilibre de l'environnement interne, produisant des changements de pH, ce qui a un effet négatif sur le transport et l'absorption des macro et micronutriments.
De plus, en raison de la diminution qui se produit dans la synthèse des acides gras à chaîne courte, l'apport énergétique aux cellules de la muqueuse est altéré et peut être, entre autres, une cause de constipation.

Microbiote muconutritionnel

Le microbiote muconutritif joue un rôle fondamental dans le maintien de l'intégrité de la couche de mucus qui tapisse la muqueuse intestinale, ainsi que la muqueuse elle-même.

La détermination qualitative et quantitative des espèces microbiennes qui composent le microbiote muconutritif n'est possible que depuis peu, grâce aux progrès des techniques de diagnostic. Ce sont des espèces qui ne peuvent pas être étalées et qu'il n'a pas été possible de déterminer et de quantifier de manière routinière jusqu'à la mise en œuvre des techniques de PCR (Polymerase Chain Reaction).

Bactéries testées :

  • Akkermansia muciniphila induit la production de mucine, favorisant la régénération de la couche de mucus dans l'intestin, qui est la niche biologique qui abrite le reste du microbiote présent dans l'intestin, ainsi que ses nutriments. Il catabolise et dégrade la mucine, produisant des acides gras à chaîne courte (SCFA - acide propionique, oligosaccharides et acide acétique -), qui servent de substrat nutritif aux bactéries du microbiote et notamment Faecalibacterium prausnitzii.
  • Faecalibacterium prausnitzii joue un rôle fondamental dans la production d'AGCC, en particulier d'acide butyrique, qui joue un rôle important dans la nutrition et le trophisme de l'épithélium intestinal, ainsi que dans l'inhibition de l'inflammation de la muqueuse de la paroi intestinale. Ces acides gras à chaîne courte servent de nourriture aux lactobacilles et aux bifidobactéries et couvrent 10 % des besoins énergétiques de l'organisme.

 

Un résultat analytique inférieur à la plage normale entraîne :

  • Nutrition insuffisante de l'épithélium intestinal
  • Un déficit dans la stimulation de la production de mucus
  • Il augmente le risque de troubles de la surface muqueuse et de manque de protection
  • Il favorise la réponse inflammatoire de la muqueuse intestinale
  • Il met en danger la fonction de la barrière intestinale

 

Importance de l'acide butyrique :

  • Anti-inflammatoire
  • Stabilisation muqueuse et réparation de la perméabilité
  • Réduction du stress oxydatif
  • Irrigation améliorée de la muqueuse intestinale
  • Contribue à la régénération du mucus
Microbiote saccharolytique primaire

Le microbiote saccharolytique primaire soutient l'activité du microbiote muco-nutritif en décomposant la structure des glucides complexes. En même temps, il stimule d'autres espèces bactériennes pour la dégradation des fibres.

Les enzymes digestives humaines ne peuvent pas décomposer les fibres alimentaires. Dans tout le tractus gastro-intestinal, cela augmente la taille du chyme, réduit sa densité énergétique et facilite le contrôle de la glycémie après ingestion. L'augmentation du volume du contenu intestinal augmente la pression sur la paroi intestinale et stimule le péristaltisme. L'activité de ces bactéries favorise la production d'acide butyrique, un micronutriment essentiel pour la nutrition et la stabilité de l'épithélium intestinal.

En particulier, certains types de fibres comme l'amidon résistant et l'oligofructose sont convertis en acide butyrique et lactique par les bactéries. En particulier, il a été rapporté que l'amidon résistant aide à réduire la résistance à l'insuline, à contrôler la diarrhée infectieuse et à prévenir le cancer colorectal.

Bifidobacterium adolescentis et Ruminococcus bromii sont des bactéries qui jouent un rôle déterminant dans la dégradation primaire de l'amidon résistant et de l'oligofructose.

BIFIDOBACTERIUM ADOLESCENTIS

Il agit sur les chaînes latérales courtes des polysaccharides et forme de l'acide acétique à partir de celles-ci. Faecalibacterium prausnitzii dépend de l'acide acétique pour décomposer les oligosaccharides et être capable de produire de l'acide butyrique à partir d'eux.

 

 

 

RUMINOCOCCUS BROMII

Non seulement vous pouvez utiliser efficacement l'amidon résistant, mais il stimule également sa dégradation par d'autres bactéries intestinales. Il s'agit notamment de Bifidobacterium adolescentis et d'autres agents de dégradation des fibres moins efficaces tels que Eubacterium rectole et Bacteroides thetaiotaomicron. Ruminococcus bromii représente entre 3 et 5% du microbiote total chez les personnes saines.

 

La réduction du microbiote saccharolytique primaire, qui dégrade les fibres, diminue le métabolisme des polysaccharides dans l'intestin. Il réduit l'apport de nutriments pour d'autres bactéries telles que Faecalibacterium prausnitzii et par conséquent la production d'acide butyrique.

Pour cette raison, il est raisonnable d'envisager les bifidobactéries complètes, ou les soutenir leur croissance, pour rendre Faecalibacterium prausnitzii.

Microbiote neuroactif

Microbiote producteur d'acide Γ-aminobutyrique (GABA), qui agit par l'intermédiaire de récepteurs dans l'intestin sur l'axe intestin-cerveau.

Comme le corps humain, dans le système nerveux central, différentes souches du microbiote neuroactif produisent la substance neurologiquement active acide γ-aminobutyrique, parfois en grande quantité. Cette circonstance de partager la capacité de synthétiser des substances neuroactives identiques, suppose une sorte de « langage commun » qui permet la communication entre les humains et les micro-organismes. Les récepteurs GABA sont répandus dans le tractus gastro-intestinal.

Le microbiote neuroactif peut interagir avec l'axe intestin-cerveau de deux manières :

  1. Les neurones du système nerveux entérique (ENS) reconnaissent le GABA produit par les bactéries et ingéré par voie orale, via les récepteurs spécifiques du GABA et transmettent les impulsions correspondantes au cerveau via le nerf vague.
  2. Dans le même temps, l'épithélium intestinal réabsorbe le GABA dans le sang. Des études récentes ont montré que de petites quantités de GABA traversent la barrière hémato-encéphalique. Le GABA entéral peut directement soutenir l'effet anxiolytique et antidépresseur du GABA produit par le cerveau.

Ainsi, le microbiote neuroactif est un modulateur important de l'axe intestin-cerveau et peut transmettre des aspects bénéfiques pour la santé à travers le GABA produit dans l'intestin.

Les récepteurs GABA sont également présents sur de nombreuses cellules immunitaires telles que les cellules dendritiques, les mastocytes et les cellules T. Par conséquent, le GABA participe également à la régulation des processus immunitaires, par exemple en inhibant la libération de cytokines pro-inflammatoires.

Candida

Le genre Candida est composé de plus de 200 espèces. De tous, Candida albicans est celui qui a l'importance médicale la plus pertinente. Dans l'intestin, il est physiologique de le retrouver en quantité <103 UFC/g de selles.

C'est un organisme unicellulaire dimorphe. Candida albicans dans la muqueuse, peut se comporter comme un pathogène facultatif. Sous sa forme levure, elle est saprophyte et inoffensive, étant la forme hyphe ou mycélienne celle qui est pathogène et invasive. Candida albicans est responsable de 60 à 75 % de toutes les mycoses.

Les facteurs prédisposant à la multiplication non physiologique du Candida sont nombreux, tels que : prise de médicaments (antibiotiques, corticoïdes, contraceptifs), surcharge en sucre dans l'alimentation, modifications du pH intestinal, diabète, grossesse...

La candidose intestinale peut se développer silencieusement pendant des années, ou produire des symptômes cliniques anodins tels que fatigue, maux de tête, ballonnements, diarrhée et/ou constipation, brûlures d'estomac, douleurs musculaires et articulaires et gêne vaginale (démangeaisons ou irritation). Il se nourrit de composés présents dans l'alimentation, principalement des glucides simples (glucose, galactose, fructose, cellulose...).

Une étude bactériologique complémentaire du microbiote protecteur, immunomodulateur, muconutritif et protéolytique est une bonne ressource pour évaluer si le diagnostic de Candida est la conséquence d'une altération du microbiote intestinal, auquel cas il sera plus pertinent cliniquement.

Un résultat au-dessus de la plage normale produit :

  • Troubles métaboliques et immunitaires
  • Modifications du pH physiologique intestinal, favorisant le développement d'une dysbiose
  • Altération de la perméabilité de la muqueuse intestinale

 

Candida comme déclencheur de réactions allergiques

Une association entre la prolifération de Candida dans le tractus gastro-intestinal et les processus allergiques [Palma-Carlos et al., 2002] ou les symptômes cutanés a été observée avec une fréquence particulière (il a été avancé que certaines réactions allergiques cutanées peuvent être causées par les antigènes de Candida, sur la base de processus immunologiques que Candida peut influencer à travers le tissu lymphatique GALT associé à l'intestin.

 

Levures

Diagnostic quantitatif et qualitatif des champignons et levures

Les champignons sont dans leur propre catégorie de formes de vie. Ils diffèrent des plantes, des animaux et des bactéries par leur structure. Leurs parois cellulaires contiennent de la chitine au lieu de la cellulose. Ils n'utilisent pas l'amidon comme réserve de nutriments, mais le glycogène.

Ils colonisent la peau et les muqueuses (digestives, génitales, buccales...) de notre organisme, pouvant produire des pathologies à ce niveau. La survenue dépend de plusieurs facteurs qualitatifs et quantitatifs endogènes du patient (dysbiose, pathologies chroniques…), ainsi que de facteurs prédisposants (alimentation, mode de vie, prise chronique de médicaments…).

Pour contenir son développement et sa croissance anormale, il est essentiel que le microbiote saprophyte qui colonise les muqueuses soit correctement réparti qualitativement et quantitativement et qu'il soit fonctionnellement actif. De cette façon, nous aurons une barrière physique et immunologique normale, qui contrôle la croissance des champignons et des levures.

Valeur du pH dans les matières fécales

Valeur du pH dans les matières fécales

La plage normale se situe entre 5,8 et 6,4.

  • Un pH acide, inférieur à 5,8, indique une malabsorption des glucides. Une fermentation partielle de celui-ci se produit, générant une grande quantité de substances acides.
  • Un pH alcalin (basique) supérieur à 6,4 indique une dysbiose à prédominance protéolytique. Les produits finaux du métabolisme des bactéries protéolytiques sont de puissants alcalinisants, en particulier l'ammoniac.
FODMAPS

Les FODMAP comprennent :

  • Oligosaccharides fermentescibles tels que galacto-oligosaccharides, stakinose Disaccharides tels que lactose
  • Monosaccharides comme le fructose
  • Polyols tels que sorbitol, mannitol, xylitol, maltitol

 

Lorsque nous ne disposons pas des enzymes spécifiques pour les digérer ou que leurs récepteurs sont saturés, le transport ou l'absorption normal ne se produit pas au niveau de l'intestin grêle, atteignant ainsi le côlon inchangé.

Ces sucres sont très osmotiques, l'augmentation en eau dilue les selles et accélère le transit intestinal, favorisant les diarrhées. Le microbiote du gros intestin les fait fermenter et produit de nombreux gaz, qui augmentent la pression sur la paroi intestinale, provoquant des douleurs et d'autres symptômes digestifs.

Sur la base de la composition du microbiote, la valeur du type de FODMAP évaluée par KyberBioma a une grande pertinence thérapeutique, indiquant le type de régime FODMAP le plus recommandé avec une maladie intestinale fonctionnelle.

Selon la composition du microbiote, trois types différents de FODMAP peuvent être attribués :

Type 1 : Les aliments contenant des FODMAP sont généralement bien tolérés

Il est peu probable qu'un régime pauvre en FODMAP soulage les symptômes du SCI

Type 2 : Les aliments avec FODMAP sont légèrement tolérés

Il est raisonnable d'essayer un régime pauvre en FODMAP pour les symptômes du SCI.

Type 3: Les aliments contenant du FODMAP doivent être évités

Un régime pauvre en FODMAP est indiqué pour le soulagement des symptômes du SCI.

Lors d'un régime pauvre en FODMAP, il est important de suivre en parallèle un régime riche en fibres, en soutien du microbiote muconutritif et du microbiote protecteur.

Indice de résilience

KyberBioma détermine la résilience du microbiote intestinal. Il décrit la stabilité d'un écosystème à être affecté face à différentes perturbations et à se renouveler sans changer fondamentalement.

  • Si l'indice est élevé, le microbiote peut conserver sa structure et ses fonctions essentielles malgré d'éventuelles influences perturbatrices.
  • Avec un indice bas, l'écologie du microbiote est plus labile et des influences néfastes peuvent générer des symptômes cliniques.